最近更新日期:2019-02-28

1.记录任务开始和完成时间

在实际使用过程中发现，对于PBS系统来说，任务提交会返回一个作业ID，任务结束后这个作业ID在用账号下就消失了。如果有不同时间提交的任务有的时候作业结束了或者停止了，就容易找不到任务的目录，甚至会忘记是什么时间提交的什么类型的计算任务。而且PBS中提供的out和err输出也仅能显示任务的错误或标准输出。所以在提交任务的同时创建一个自己的任务记录日志就十分有必要。

这里主要使用echo、date、time命令，结合PBS的环境变量$PBS_JOBID、$PBS_JOBNAME、$PBS_O_WORKDIR在PBS中写一行小代码来完成。

#输出作业开始时间、任务ID、作业名、作业目录
echo ''$PBS_JOBID'  named  '$PBS_JOBNAME' in '$PBS_O_WORKDIR'  started at  '`date`'  ' >> /your_dir.log

#记录vasp实际运行时间输出到`任务ID.out`文件，同时将vasp程序运行的实时消息传递到当前目录下的`VASP.out`文件
time mpirun -genv I_MPI_DEVICE rdssm -np 36 vasp_std > VASP.out

#输出作业结束时间、任务ID、作业名、作业目录
echo ''$PBS_JOBID'  named  '$PBS_JOBNAME' in '$PBS_O_WORKDIR'  finished at  '`date`'\n  ' >> your_dir/log

关于date命令：Linux date命令 | 菜鸟教程

关于time命令：Linux date命令 | 菜鸟教程